W pierwszej dekadzie działalności Fundacja Centrum Stosunków Międzynarodowych realizowała projekty poświęcone przede wszystkim
- integracji Polski z UE,
- relacjom dwustronnym Polska – Niemcy, Polska – Rosja i Polska-USA,
- wyzwaniom związanym z europejskimi migracjami
- zmianom w światowym układzie sił po rozpadzie ZSRR i zakończeniu „zimnej wojny”.
